Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm28305F6U473 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm28305F6U473 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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