Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3072F6SKY8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms