Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm29094F6Q785 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm29094F6Q785 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm29094F6Q785 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms