Protein–RNA interactions for Protein: E9QA22

Zfp644, Zinc finger protein 644, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp644E9QA22 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zfp644E9QA22 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Zfp644E9QA22 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zfp644E9QA22 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms