Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cald1E9QA15 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cald1E9QA15 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms