Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A430078G23RikE9Q7Y4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A430078G23RikE9Q7Y4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms