Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r48E9Q5D8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r48E9Q5D8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms