Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Susd1E9Q3H4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd1E9Q3H4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms