Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Y9

Krt83, Keratin 83, mousemouse

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Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt83E9Q1Y9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Krt83E9Q1Y9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Krt83E9Q1Y9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Krt83E9Q1Y9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Krt83E9Q1Y9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Krt83E9Q1Y9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt83E9Q1Y9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Krt83E9Q1Y9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Krt83E9Q1Y9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Krt83E9Q1Y9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Krt83E9Q1Y9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Krt83E9Q1Y9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt83E9Q1Y9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms