Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd2E9Q1M1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd2E9Q1M1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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