Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E430018J23RikE9PZQ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E430018J23RikE9PZQ8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms