Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph10bE9PYQ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rsph10bE9PYQ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms