Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3002E9PW72 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3002E9PW72 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms