Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc62E9PVD1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc62E9PVD1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms