Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cngb1E1AZ71 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cngb1E1AZ71 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cngb1E1AZ71 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms