Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5430403G16RikD3Z5L4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms