Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc6D3YZP9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc6D3YZP9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms