Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ldlrad1D3YYZ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ldlrad1D3YYZ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms