Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700006A11RikB9EHI3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700006A11RikB9EHI3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700006A11RikB9EHI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms