Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20547B8JJN0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20547B8JJN0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20547B8JJN0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20547B8JJN0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20547B8JJN0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Gm20547B8JJN0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20547B8JJN0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Gm20547B8JJN0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20547B8JJN0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Gm20547B8JJN0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm20547B8JJN0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20547B8JJN0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20547B8JJN0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20547B8JJN0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20547B8JJN0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20547B8JJN0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20547B8JJN0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20547B8JJN0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Gm20547B8JJN0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20547B8JJN0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Gm20547B8JJN0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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