Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phf11bB4XVQ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf11bB4XVQ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11bB4XVQ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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