Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU015836B2RUM3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AU015836B2RUM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AU015836B2RUM3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms