Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrt4B2RU40 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrt4B2RU40 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms