Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JrklB2RRL2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrklB2RRL2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrklB2RRL2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms