Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf518bB2RRE4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf518bB2RRE4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms