Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf3B2RQG2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf3B2RQG2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms