Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms