Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brpf3B2KF05 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf3B2KF05 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf3B2KF05 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms