Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Mbd5B1AYB6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mbd5B1AYB6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd5B1AYB6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms