Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint7A7XV04 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skint7A7XV04 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint7A7XV04 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms