Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skint5A7XUY5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Skint5A7XUY5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Skint5A7XUY5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms