Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M5A7VMS3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-M5A7VMS3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms