Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pfkfb3A7UAK5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfkfb3A7UAK5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms