Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E5

Ttll3, Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3A4Q9E5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttll3A4Q9E5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll3A4Q9E5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms