Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3aA2ASI5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn3aA2ASI5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn3aA2ASI5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms