Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SktA2AQ25 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SktA2AQ25 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms