Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SetxA2AKX3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms