Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Lcn6A2AJB9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Lcn6A2AJB9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Lcn6A2AJB9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Lcn6A2AJB9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Lcn6A2AJB9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lcn6A2AJB9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Lcn6A2AJB9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Lcn6A2AJB9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Lcn6A2AJB9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Lcn6A2AJB9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Lcn6A2AJB9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Lcn6A2AJB9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lcn6A2AJB9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms