Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Prdm12A2AJ77 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prdm12A2AJ77 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prdm12A2AJ77 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms