Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyb561d1A2AE42 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cyb561d1A2AE42 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms