Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf19bA2A7Q9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf19bA2A7Q9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf19bA2A7Q9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf19bA2A7Q9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf19bA2A7Q9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf19bA2A7Q9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf19bA2A7Q9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf19bA2A7Q9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf19bA2A7Q9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf19bA2A7Q9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Rnf19bA2A7Q9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Rnf19bA2A7Q9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Rnf19bA2A7Q9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Rnf19bA2A7Q9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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