Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm2A2A7B5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prdm2A2A7B5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prdm2A2A7B5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms