Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm6268A2A3U9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm6268A2A3U9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm6268A2A3U9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms