Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RNP2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0U1RNP2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RNP2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms