Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms