Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms