Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms