Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv31A0A075B5J5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv31A0A075B5J5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms