Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm15423-201ENSMUST00000150600 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm14138-201ENSMUST00000122061 745 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm42527-201ENSMUST00000198173 1480 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 AC093022.2-202ENSMUST00000227500 866 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 1700063H04Rik-201ENSMUST00000043553 817 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Stat1-203ENSMUST00000186057 3998 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Itgb1P09055 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms