Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zbed5B2RPU8 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zbed5B2RPU8 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms